治疗上主要采用物理治疗和外用药物治疗，系统药物治疗多用于皮损数目较多或久治不愈者。
物理治疗如冷冻、电灼、刮除和激光等，皮损数目较多者可以分批分次治疗。
外用药物治疗不宜采用物理治疗的患者，可根据不同情况选择外用药物及使用方法。常用药物包括氟尿嘧啶软膏、3%酞丁胺霜或3%酞丁胺二甲亚砜溶液，以及5%咪喹莫特软膏。
皮损内注射平阳霉素用1%普鲁卡因稀释于疣体根部注射，适用于难治性寻常疣和跖疣；维生素D3皮损内注射对于多发性疣具有一定疗效。
系统药物治疗如尚无确切有效的抗HPV治疗药物，可试用免疫调节剂(如干扰素、左旋咪唑等)。
预防注意劳动保护，防止受伤。